En el departamento de Puno encontramos en total dos universidades y son netamente estatales es decir subvencionadas por el estado, ambas están licenciadas por la SUNEDU por lo que tienen un largo futuro y seguridad de que los títulos como los graduados tengan un respaldo por parte de estas y del gobierno de forma legal. También es posible encontrar algunas sedes de universidades que no son netamente de Puno pero que son privadas y funcionan con permiso del gobierno.
Universidad Nacional del Altiplano UNAP
Es la institución más reconocida de Puno, fue creada en el año 1856 por la ley 406 la que en un principio tuvo el nombre de “Universidad de Puno” estando el gobierno del país Ramón Castilla y Marquesado. La enseñanza empezó con las carreras de Ciencias Naturales, Filosofía y Letras, Jurisprudencia, Matemáticas, Medicina y Teología.
Dirección: Av. Floral 1153
El primer rector fue Juan Cazorla funcionando desde 1856 hasta 1863 cerrando por motivos económicos en 1864, fue nuevamente abierta el 10 de febrero de 1961 por ley 13516 en el gobierno presidencial de Manuel Prado Ugarteche iniciando la enseñanza nuevamente un 29 de abril de 1962. Finalmente toma el nombre de Universidad Nacional del Altiplano en 1983 por la ley 23733 quedándose con esta denominación.
Facultad de Ciencias Agrarias
- Escuela Profesional de Ingeniería Agronómica
- Escuela Profesional de Ingeniería Agroindustrial
- Escuela Profesional de Ingeniería Topográfica y Agrimensura
Facultad de Ingeniería Agrícola
- Escuela Profesional de Ingeniería Agrícola
Facultad de Ingeniería Civil y Arquitectura
- Escuela Profesional de Ingeniería Civil
- Escuela Profesional de Arquitectura y Urbanismo
Facultad de Ingeniería Económica
- Escuela Profesional de Ingeniería Económica
Facultad De Ingeniería Estadística e Informática
- Escuela Profesional de Ingeniería Estadística e Informática
Facultad de Ingeniería Geológica y Metalúrgica
- Escuela Profesional de Ingeniería Geológica
- Escuela Profesional de Ingeniería Metalúrgica
Facultad de Ingeniería Mecánica Eléctrica, Electrónica y Sistemas
- Escuela Profesional de Ingeniería Electrónica
- Escuela Profesional de Ingeniería Mecánica Eléctrica
- Escuela Profesional de Ingeniería de Sistemas
Facultad de Ingeniería de Minas
Escuela Profesional de Ingeniería de Minas
Facultad de Ingeniería Química
- Escuela Profesional de Ingeniería Química
Facultad de Ciencias Biológicas
- Escuela Profesional de Ciencias Biológicas
- Escuela Profesional de Ciencias Biológicas: Pesquería
- Escuela Profesional de Ciencias Biológicas: Microbiología
Facultad de Ciencias de la Salud
- Escuela Profesional de Nutrición Humana
- Escuela Profesional de Odontología
Facultad de Enfermería
- Escuela Profesional de Enfermería
Facultad de Medicina Humana
- Escuela Profesional de Medicina Humana
Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia
- Escuela Profesional de Medicina Veterinaria y Zootecnia
Facultad de Ciencias Contables y Administrativas
- Escuela Profesional de Ciencias Contables
Facultad de Ciencias de la Educación
- Escuela Profesional de Física
- Escuela Profesional de Inicial
- Escuela Profesional de Primaria
- Escuela Profesional de Secundaria
Facultad de Ciencias Jurídicas y Políticas
- Escuela Profesional de Derecho
Facultad de Ciencias Sociales
- Escuela Profesional de Antropología
- Escuela Profesional de Arte
- Escuela Profesional de Ciencias de la Comunicación Social
- Escuela Profesional de Sociología
- Escuela Profesional de Turismo
Facultad de Trabajo Social
- Escuela Profesional de Trabajo Social
Facultad de Ciencias Administrativas y Humanas
- Escuela Profesional de Administración
Universidad Nacional de Juliaca UNAJ
Como su nombre lo dice se encuentra en la provincia de Juliaca históricamente la que más progreso tuvo inclusive mayor a la capital Puno por lo que esta universidad tiene una buena ubicación, fue creada el 25 de julio del 2007 por ley 29074 cumpliendo el 22 de setiembre del 2011 con el Reglamento General del Proceso de Admisión a las Universidades por la CONAFU.
Dirección: Nueva Zelanda 631, Juliaca
Escuelas profesionales:
- Administración y Emprendimiento Empresarial
- Economía
- Gestión Pública y Desarrollo Social
- Ingeniería Ambiental y Forestal
- Ingeniería de Software y Sistemas
- Ingeniería en Energías Renovables
- Ingeniería en Industrias Alimentarias
- Ingeniería Industrial
- Ingeniería Mecatrónica
- Ingeniería Textil y de Confecciones
Universidad Peruana Unión
Es una sede de la universidad que la podemos encontrar en Puno, en el 2002 recibió oficialmente su autorización de funcionamiento en el departamento.
Dirección: C. Salida a Arequipa Km. 6 Chullunquiani, Autopista Héroes de la Guerra del Pacifico
Carreras profesionales:
- Arquitectura
- Educación, Especialidad Inglés y Español
- Educación Primaria y Pedagogía Terapéutica
- Ingeniería Ambiental
- Ingeniería Civil
- Ingeniería de Industria Alimentarias
- Ingeniería de Sistemas
- Nutrición Humana
- Psicología
Existieron otras universidades en Puno como la Universidad Andina Néstor Cáceres Velásquez, Universidad Privada San Carlos y la sede de la Universidad Alas Peruanas las cuales fueron cerradas por la SUNEDU en su proceso de licenciamiento.